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Étude de la circulation de la dengue, de la fièvre jaune et des virus du Nil occidental en Guinée : implications pour atteindre les objectifs sanitaires du programme Simandou 2040
  • Mamadou Boundoukhoura Bah1, Mariama Diallo1, Alphonse Keller Konkon1, Mamadou Morou Barry1, Aissatou Boiro1, Ibrahima Baϊlo Diallo1, Ibrahima Sory Sow1, Thierno Amadou Labe Balde1, Salifou Talasson Bangoura3, Kirill Zakharov1, Gbago Onivogui1, Sanaba Boumbaly2, Ekaterina Naidenova1 and Mohamed Sahar Traore1*
  • 28 Jul 2026
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Article

Étude de la circulation de la dengue, de la fièvre jaune et des virus du Nil occidental en Guinée : implications pour atteindre les objectifs sanitaires du programme Simandou 2040

Journal : Tropical Medicine and Health
Volume : 54
Pages : 133
DOI : DOIhttps://doi.org/10.1186/s41182-026-01031-4
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Résumé

Contexte Des maladies telles que la dengue, la fièvre jaune et le virus du Nil occidental, transmises par les arthropodes, posent des problèmes de santé publique dans les régions tropicales et subtropicales. Comme beaucoup de pays d’Afrique de l’Ouest, la Guinée possède toutes les conditions favorables à la circulation de ces virus. Cela inclut l’écologie locale et le climat, ainsi que la présence de vecteurs qui transmettent ces virus. Malgré leur importance médicale, ces virus ont fait l’objet d’études limitées, et les informations à jour sur leur circulation restent rares. Dans ce contexte, la présente étude a examiné la prévalence de ces trois arbovirus (DENV, YFV et WNV) chez les populations humaines et vectorielles. Méthodologie Cette étude a couvert 18 préfectures de Guinée, réparties dans les quatre zones écologiques du pays. L’étude a été menée du 27 mai au 27 novembre 2024. Dans les centres de santé sélectionnés dans chaque préfecture, des échantillons de 5 ml de sang veineux ont été prélevés sur des patients asymptomatiques âgés de 1 à 90 ans, qui avaient visité les consultations et avaient donné leur consentement. De plus, les moustiques ont été collectés via un piège lumineux « AMPLECTA MOSQUITO TRAP ». Deux tests ELISA ont été réalisés sur les échantillons de sang : le premier pour la détection et le second pour confirmer la présence de ces virus dans le sérum humain. Les échantillons de moustiques ont été analysés pour déterminer la diversité, et une PCR en temps réel a été utilisée pour détecter une infection virale dans les vecteurs après l’extraction d’ARN viral via le kit AmpliSens® de préparation à RIBO. Résultats Des preuves sérologiques d’exposition aux trois virus dans les dix-huit préfectures étudiées indiquent leur large répartition à travers le pays. La séroprévalence la plus élevée des anticorps contre le virus de la dengue a été observée à N’Zerekore (43,9 % [38,5–49,4 %]), tandis que la séroprévalence la plus élevée des anticorps contre la fièvre jaune a été enregistrée dans la préfecture de Kankan (54,7 % ; IC à 95 % : 41,5–67,3). Chez Forecariah, jusqu’à 53,0 % (IC 95 % : 42,4–63,4) des participants étaient séropositifs aux anticorps du virus du Nil occidental. La séropositivité pour ces arbovirus était plus fréquemment observée chez les adultes. Une séroprévalence plus élevée des anticorps contre la dengue et la fièvre jaune a également été observée chez les agriculteurs et les éleveurs. Une séroprévalence plus élevée des anticorps contre la dengue et la fièvre jaune a également été observée chez les agriculteurs et les éleveurs. Aucune infection à la dengue ou à la fièvre jaune n’a été détectée chez les vecteurs, tandis que la population de Culex quinquefasciatus a été identifiée par le WNV. Conclusion Cette étude fournit des preuves sérologiques d’exposition à la dengue, à la fièvre jaune et aux virus du Nil occidental dans toutes les régions écologiques de la République de Guinée. De plus, des anticorps contre ces virus ont été détectés dans des populations humaines, et des bassins de moustiques positifs à l’arbovirus ont été identifiés lors d’enquêtes entomologiques. Des preuves du virus du Nil occidental ont également été détectées dans des bassins de moustiques contenant Culex quinquefasciatus, suggérant un rôle possible de cette espèce dans le cycle de transmission local. Les agriculteurs adultes et les éleveurs semblent être les plus à risque de contracter la dengue et la fièvre jaune. Ces résultats soulignent la nécessité d’un système intégré de surveillance des arbovirus en Guinée. Ce système doit combiner la surveillance sérologique avec des enquêtes entomologiques afin de soutenir les objectifs de santé publique du programme Simandou 2040.

Contenu

Introduction

Les maladies arbovirales, notamment la dengue, la fièvre jaune, la chikungunya, le virus du Nil occidental et le Zika, représentent une menace mondiale pour la santé publique [1, 2]. Ces maladies sont classées comme émergentes et réémergentes ; ils sont transmis par les moustiques, se sont propagés vers de nouvelles zones géographiques et se sont intensifiés ces dernières décennies [3, 4]. Les virus responsables de ces maladies appartiennent aux genres Flavivirus et Alphavirus et se propagent par des arthropodes sanguins, principalement des moustiques des genres Aedes et Culex [4, 5]. Les virus notables de ces genres incluent le virus de la dengue (DENV), le virus de la fièvre jaune (YFV), le virus du Nil occidental (WNV), le virus Zika (ZIKV) et le virus chikungunya (CHIKV), qui sont d’une importance médicale majeure chez l’humain [2]. La dengue se manifeste généralement par une simple fièvre, mais elle peut évoluer vers une fièvre hémorragique. La fièvre jaune provoque de graves lésions hépatiques. Le virus du Nil occidental peut entraîner de graves troubles neurologiques, et le Zika est souvent associé à des troubles neurologiques et congénitaux [6]. En revanche, le chikungunya provoque de fortes douleurs articulaires qui peuvent parfois devenir chroniques [7]. Ces maladies se caractérisent par un fort potentiel épidémique, une propagation géographique rapide et une pression croissante sur les systèmes de santé à travers le monde [8].

De plus, les statistiques mondiales classent la dengue comme la maladie arbovirale la plus significative. Plus de 100 à 400 millions de cas sont signalés chaque année dans le monde, dont 3,18 millions de cas et 28 000 décès en 2019 [2]. De plus, le chikungunya et le Zika représentent respectivement 693 000 et 500 000 cas par an. La fièvre jaune représente environ 130 000 cas et 30 000 décès par an. Bien que moins bien documenté, le virus du Nil occidental provoque environ 2 588 cas graves chaque année [2]. Ces arbovirus sont présents en Afrique et se manifestent souvent sous forme d’épidémies récurrentes [9, 10]. En Afrique, un total de 245 176 cas suspects de dengue ont été signalés en 2023, dont 18 697 cas confirmés et 771 décès [11]. La majorité des décès ont été enregistrés au Burkina Faso, qui à lui seul a causé 688 décès liés à la dengue. La même année, 104 cas confirmés de fièvre jaune et 39 décès associés ont été signalés. Le Nigeria a été le pays le plus touché, avec 21 décès, suivi du Cameroun (6 décès), de la République centrafricaine et de la Guinée (4 décès chacun), et du Congo (2 décès). Concernant le virus du Nil occidental, 12 cas confirmés et 2 décès ont été signalés à travers l’Afrique. La Tunisie a représenté 10 cas et un décès, tandis que la Namibie et le Sénégal, les deux autres pays concernés, ont chacun signalé un seul cas [11]. La plupart des épidémies liées à ces maladies se produisent en Afrique de l’Ouest [12]. Ces résultats démontrent pourquoi cette région mérite une attention particulière lorsqu’on aborde cette question. De plus, des épidémies de dengue ont été fréquemment signalées dans des pays frontaliers de la Guinée, tels que le Sénégal et la Côte d’Ivoire, ce qui contribue significativement à la charge régionale [13, 14]. L’intensification de la transmission de ces arbovirus, ainsi que le risque accru d’épidémies, sont motivés par plusieurs facteurs. Cela inclut une urbanisation rapide, une forte croissance démographique et des changements environnementaux. Ces changements ont contribué à l’abondance et à la propagation de vecteurs, tels qu’Aedes aegypti, Aedes albopictus et Culex quinquefasciatus [15,16,17,18,19].

La circulation des arbovirus en Guinée a été documentée depuis plusieurs décennies grâce à des enquêtes cliniques et des études sérologiques menées dans diverses régions [20, 21]. Entre 2000 et 2024, jusqu’à 947 cas confirmés de fièvre jaune et 284 décès liés ont été signalés en Guinée. Concernant la dengue, deux cas confirmés, dont un décès, ont été enregistrés entre 2023 et 2024 [21]. À ce jour, aucune étude n’a documenté la circulation du virus du Nil occidental en Guinée. Cependant, ces données sont souvent incomplètes et abordent rarement la répartition de l’infection parmi les vecteurs moustiques, laissant les données épidémiologiques nationales sur la circulation des arbovirus incomplètes. L’augmentation de la déforestation en République de Guinée crée des conditions climatiques favorables à la prolifération des vecteurs, rendant le pays vulnérable à des épidémies virales récurrentes [22]. Le renforcement de la surveillance intégrée des arbovirus est une priorité. Dans ce contexte, cette étude a été conçue sur la base d’une approche combinée intégrant enquêtes sérologiques humaines et surveillance entomologique. Cette étude a évalué la circulation de la dengue, de la fièvre jaune et des virus du Nil occidental dans la population humaine ainsi que parmi les vecteurs impliqués dans leur transmission. Ce travail s’inscrit pleinement dans l’approche « One Health », qui reconnaît l’interdépendance des facteurs environnementaux, de l’écologie des vecteurs et de la santé humaine. Dans ce contexte, la séroprévalence est un indicateur crucial pour évaluer l’exposition cumulative de la population et identifier la circulation virale silencieuse ou sous-diagnostiquée. Cette étude visait à étudier la circulation de la dengue, de la fièvre jaune et des virus du Nil occidental en Guinée, tant chez les populations humaines que chez les moustiques vecteurs, afin d’élucider leur dynamique de transmission. Les résultats devraient générer des preuves qui guideront les autorités de santé publique et contribueront aux objectifs du programme Simandou 2040, en particulier ceux liés au renforcement des systèmes de santé, à l’amélioration de la surveillance des maladies et à l’amélioration de la prévention et du contrôle des maladies arbovirales en République de Guinée.

Méthodologie

Conception de l’étude et site

Cette étude transversale a été réalisée sur une période de sept mois, du 27 mai au 27 novembre 2024. Cette étude a intégré des composantes séro-épidémiologiques et entomologiques et a évalué la circulation des arbovirus parmi la population humaine et les vecteurs. Des investigations ont été menées dans 18 préfectures réparties sur quatre zones écologiques : Basse-Guinée (Conakry, Coyah, Dubreka, Forecariah, Kindia et Telemele) ; la Guinée moyenne (Dalaba, Labe, Mamou, Pita et Koubia) ; la Haute Guinée (Kankan, Siguiri, Kouroussa et Dabola) ; et la Guinée forestière (N’Zerekore, Gueckedou et Kissidougou) en République de Guinée (Fig. 1).

Fig. 1

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Carte du site de l’étude

Population étudiée

Les préfectures ont été sélectionnées par échantillonnage aléatoire à partir de la base de données nationale des préfectures. De plus, au sein des préfectures sélectionnées, les hôpitaux préfectoraux ont été désignés comme sites d’échantillonnage pour la collecte de données. Cette étude comprenait des patients asymptomatiques (c’est-à-dire sans fièvre ni signes d’infection aiguë) qui avaient été vus dans des hôpitaux préfectoraux pendant la période d’étude et n’avaient jamais été vaccinés contre la fièvre jaune. Les participants qui ont déclaré ne pas avoir été vaccinés contre la fièvre jaune ont été vérifiés sur la base de leurs dossiers médicaux ou de leurs cartes de vaccination avant d’être inclus dans l’étude. Les patients éligibles étaient ceux qui acceptaient de participer après avoir reçu des informations détaillées sur les objectifs et procédures de l’étude. Ils devaient également résider dans la zone d’étude, avoir entre un et 90 ans, et ne jamais avoir reçu de vaccin contre la fièvre jaune.

Échantillonnage et traitement des moustiques vecteurs

L’échantillonnage de moustiques vecteurs a été réalisé dans six préfectures réparties dans les principales zones écologiques du pays. Plus précisément, la Basse Guinée était représentée par Conakry et Kindia, la Moyenne Guinée par Mamou et Labe, la Guinée supérieure par Kankan, et la Guinée forestière par N’Zerekore. Quatre pièges lumineux « AMPLECTA MOSQUITO TRAP » ont été installés à l’extérieur de certains foyers dans chaque préfecture de 19h00 à 7h00. Après la collecte, les échantillons ont été identifiés aux clés morphologiques Huang [23] et Coetzee et al.[24]. Les espèces identifiées ont été placées dans des tubes étiquetés selon leur espèce, leur site de collecte et leur date de collecte. Les échantillons étaient stockés sur de la glace sèche à des températures inférieures à − 20 °C et transportés au laboratoire tout en maintenant la chaîne froide.

Analyse en laboratoire d’échantillons de moustiques

Des bassins de 30 individus ont été créés par espèce et site de collecte. Les acides nucléiques ont été isolés à l’aide d’un ensemble de réactifs « RIBO-Prep », et la réaction de transcription inverse a été réalisée avec des « REVERTA-L » (deux médicaments fabriqués par l’Institut central de recherche épidémiologique de Russie). Le matériel obtenu a été testé par réaction en chaîne par transcription inverse par polymérase (RT-PCR) à l’aide de kits de réactifs pour identifier les ARN des agents pathogènes suivants : DENV (« AmpliSens® Dengue virus type –Fl »), YFV (« AmpliSens® YFV -FL ») et « AmpliSens® WNV-FL » (Institut central de recherche en épidémiologie, Russie).

Prélèvement et traitement des échantillons sanguins chez l’humain

Prélèvement de sang

Un échantillon de sang veineux de 5 mL a été prélevé par du personnel de santé qualifié dans des conditions strictes de biosécurité. Des stériles, des fournitures à usage unique et des équipements de protection individuelle appropriés ont été utilisés. Après que les échantillons aient été laissés s’acclimater à température ambiante, ils étaient centrifugés à 10 à 3 000 tr/min pour obtenir le sérum. Le sérum a ensuite été divisé en tubes marqués pour une analyse ultérieure.

Analyse en laboratoire des échantillons de sang

Des échantillons séromiques ont été testés pour détecter la présence d’anticorps IgG spécifiques au virus via un ELISA indirect réalisé selon les instructions du fabricant (« BIOSERVIS », Russie). Les valeurs de densité optique ont été interprétées selon des critères de seuil prédéfinis pour déterminer la séropositivité. En raison de la réactivité croisée sérologique connue entre les flavivirus, tous les échantillons initialement positifs à l’IgG contre le virus de la dengue (DENV), le virus du Nil occidental (WNV) ou le virus de la fièvre jaune (YFV) ont été retestés via des kits ELISA commerciaux (EUROIMMUN, Allemagne) spécifiques à chaque virus afin de valider les résultats.

Analyses statistiques

Les données ont été analysées via le logiciel R (version 4.5.2). Une analyse descriptive a été réalisée sur la base des variables quantitatives et qualitatives de l’étude. Ces variables étaient décrites en termes de comptages et de proportions. Pour améliorer la robustesse des estimations, nous avons calculé des intervalles de confiance à 95 % pour chaque proportion via la méthode de Wilson, reconnue pour sa performance supérieure, en particulier pour de petites tailles d’échantillons ou des proportions proches de 0 ou 1. Pour évaluer les cas de coinfection, nous avons calculé la proportion d’individus coinfectés dans tous les échantillons. Les intervalles de confiance (IC à 95 %) ont été calculés via l’approximation binomiale (type de Wald). La richesse en espèces (S) a été déterminée par préfecture et correspond au nombre d’espèces de moustiques collectées par site. Une analyse des composantes principales (ACP) a été réalisée pour examiner la relation entre l’occupation et l’infection avec les trois virus étudiés.

Pour l’étude de la diversité des moustiques vecteurs, l’abondance relative (Pi) de chaque espèce a été calculée pour chaque site via la formule suivante : Pi = ni/N, où ni est le nombre d’individus de l’espèce i, N est le nombre total d’individus rencontrés, et i varie de 1 à S pour chaque site d’étude. Les résultats sont présentés sous forme de tableaux et de graphiques résumés qui intègrent à la fois les proportions observées et leurs intervalles de confiance. Cela a facilité l’interprétation et la comparaison des indicateurs.

Résultats

Répartition globale de la séroréactivité au virus de la dengue, au virus de la fièvre jaune et au virus du Nil occidental dans la population humaine

Les taux globaux de séroprévalence des anticorps réactifs à la dengue, à la fièvre jaune et aux infections au virus du Nil occidental dans la population humaine étaient respectivement de 18,22 %, 23,86 % et 25,36 % (Fig. 2).

Fig. 2

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Distribution globale des taux de prévalence des anticorps réactifs au virus de la dengue, au virus de la fièvre jaune et au virus du Nil occidental en République de Guinée

Répartition de la séroréactivité au virus de la dengue, au virus de la fièvre jaune et au virus du Nil occidental par préfecture dans la population humaine

L’analyse de la séroractivité basée sur ELISA au virus de la dengue, au virus de la fièvre jaune et au virus du Nil occidental dans la population humaine a révélé une hétérogénéité géographique marquée entre les préfectures (Tableau 1). La séroprévalence des anticorps réactifs au virus de la dengue variait de 0 % [0–4,4] chez Forecariah à 43,9 % [38,5–49,4] chez N’Zerekore. Une séroractivité élevée a également été observée dans les préfectures de Siguiri (22,9 % [12,1 %-39 %]), Kissidougou (24,3 % [17,9 %-32 %]), Kankan (35,8 % [24,3 %-49,3 %]) et Gueckedou (27,6 % [19,3 %-37,8 %]). Pour le virus du Nil occidental, la séroprévalence variait de 5,7 % [3,4–9,3] à Conakry à 53 % [42,4–63,4] à Forecariah. Les préfectures avec des estimations de séroprévalence supérieures à 30 % comprenaient Kankan (35,8 % [24,3–49,3]), Koubia (37,1 % [23,2–53,7]), Kouroussa (30,8 % [12,7–57,6]), Labe (37,9 % [28,8–47,9]), Mamou (34,9 % [26,5–44,4]) et Siguiri (34,3 % [20,8–50,8]). Ces taux témoignent de la circulation de ce virus, longtemps négligée. La séroractivité du virus de la fièvre jaune variait de 5,7 % (1,6–18,6) chez Koubia à 54,7 % (41,5–67,3) dans Kankan. Dans l’ensemble, ces résultats suggèrent une exposition ou une circulation généralisée aux trois virus dans les 18 préfectures étudiées.

Tableau 1 Séroprévalence des anticorps réactifs à ELISA contre le virus de la dengue, le virus de la fièvre jaune et le virus du Nil occidental par préfecture

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Répartition de la séroactivité sur les arbovirus à travers la zone écologique

Une analyse des distributions des anticorps réactifs à ELISA contre la dengue, le Nil occidental et les virus de la fièvre jaune dans les quatre zones écologiques de Guinée (Basse-Guinée, Guinée forestière, Guinée supérieure et Moyenne Guinée) a révélé la présence des trois virus. La séroprévalence des anticorps réactifs au virus de la dengue était de 13,7 % [10,5–17,8], 24,8 % [18–33,2], 36,1 % [32,2–40,3] et 7,2 % [5,6–9,2] en Guinée moyenne, en Guinée supérieure, en Guinée forestière et en Guinée inférieure, respectivement. Des estimations élevées de séroprévalence ont été observées en Guinée supérieure et en Guinée forestière. Les estimations de séroprévalence pour le virus de la fièvre jaune variaient de 9,1 % [7–11,9] en Guinée forestière à 52,1 % [43,2–60,8] en Guinée supérieure, tandis que celles pour le VNO variaient de 17,5 % [15–20,3] en Guinée inférieure à 36,4 % [28,3–45,2] en Guinée supérieure. Ces résultats démontrent l’hétérogénéité des schémas de séroractivité de ces trois virus à travers les zones écologiques de Guinée (Tableau 2).

Tableau 2 Proportion d’échantillons réactifs à ELISA par rapport au virus de la dengue, au virus de la fièvre jaune et au virus du Nil occidental par zone écologique

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Répartition de la séroprévalence par groupe d’âge pour le virus de la dengue, le virus de la fièvre jaune et le virus du Nil occidental

La distribution des estimations de séroprévalence par groupe d’âge a révélé des variations dans les schémas de séroractivité des arbovirus selon les catégories d’âge (Fig. 3). La séroprévalence la plus élevée des anticorps réactifs au virus de la dengue a été observée chez les personnes âgées de 25 à 64 ans (22,4 % [19,8–25,3 %]). La séroprévalence des anticorps réactifs à la séroprévalence des anticorps réactifs au virus du Nil occidental est relativement élevée chez les enfants âgés de 0 à 14 ans (28,6 % [23,5–34,3 %]). De plus, les estimations de séroprévalence des anticorps réactifs à la fièvre jaune variaient de 18,8 % [11,4–29,6] chez les adultes âgés de 65 ans et plus à 27,3 % [24,5–30,3] chez les adultes âgés de 25 à 64 ans. Ces résultats suggèrent des différences liées à l’âge dans l’exposition ou la séroactivité à ces arbovirus.

Fig. 3

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Proportion d’échantillons réactifs au virus de la dengue, au virus de la fièvre jaune et au virus du Nil occidental par groupe d’âge

Schémas de séroactivité multiple au virus de la dengue, à la fièvre jaune et au virus du Nil occidental

L’analyse des données sérologiques a révélé des schémas de réactivité multiple aux arbovirus dans la population humaine (Fig. 4). Les schémas de double sésoractivité les plus fréquemment observés concernaient le virus de la fièvre jaune et le virus du Nil occidental, ainsi que le virus de la dengue et le virus de la fièvre jaune, avec des proportions de 17,1 % [13,6–21,0] et 10,3 % [7,4–13,8], respectivement. De plus, la séroractivité concomitante au virus de la dengue et au virus du Nil occidental était moins fréquente, représentant 3,0 % [1,6–5,2]. De plus, une séroactivité simultanée au virus de la dengue, au virus de la fièvre jaune et au virus West Nil a été observée dans 2,3 % [1,0–4,3 %] des échantillons.

Fig. 4

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Schémas de séroractivité multiple au virus de la dengue, au virus de la fièvre jaune et au virus du Nil occidental chez la population humaine

Variation de la séroprévalence par catégorie professionnelle

L’analyse du chi-carré (χ2) a révélé une association statistiquement significative entre l’appartenance au groupe et toutes les variables catégorielles examinées, y compris la profession (p < 0,0001), le groupe professionnel (p < 0,0001), la catégorie d’âge (p = 1,35 × 10⁻3⁰⁷), le sexe (p = 1,54 × 10⁻11⁷) et la localité (p = 4,67 × 10⁻5⁷), ainsi que des marqueurs sérologiques tels que la dengue IgG (p = 1,55 × 10⁻14) et la fièvre jaune IgG (p = 7,22 × 10⁻5).

Dans le groupe 3, les professions les plus représentées étaient les femmes au foyer (35,6 % ; p < 10⁻115), les professionnels de santé (18,7 %), le personnel administratif (16,6 %) et les commerçants (13,5 %). Ce groupe était principalement associé à des zones urbaines et périurbaines, notamment Conakry, Kindia, Mémou et Labé. Ces localités présentaient également une séroractivité relativement élevée à la fièvre jaune (29,5 % ; p < 0,001).

Le groupe 4 se caractérisait par des groupes professionnels tels que les agriculteurs (38,4 % ; p < 10⁻11⁷), les ouvriers manuels (34,6 % ; p < 10⁻4⁰) et les éleveurs d’élevage (13,6 % ; p < 10⁻3⁸). Ce groupe, composé principalement d’hommes (86,2 % ; p < 10⁻⁹⁸) et d’adultes (âge moyen = 36,0 ans ; p < 10⁻2⁹), a montré la plus forte séroreactivité à la dengue (31,5 % ; p < 10⁻15). Les estimations de séroractivité les plus élevées ont été observées dans les préfectures de N’Zerekore (33,0 %), Kissidougou (17,2 %) et Gueckedou (9,4 %).

Les clusters 1, 2 et 5 se caractérisaient par une prédominance d’élèves, d’écoliers et de retraités, avec une séroractivité relativement plus faible par rapport aux virus étudiés. Ces groupes étaient principalement associés aux préfectures de Siguiri, Dabola, Kankan, Kouroussa et Dubreka (Figs. 5, 6 et 7).

Fig. 5

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Caractérisation des amas

Fig. 6

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Répartition du sexe et séroprévalence par groupe

Fig. 7

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Répartition des préfectures et des catégories socioprofessionnelles par groupe

Diversité des espèces de moustiques en Guinée

Un total de 3946 moustiques ont été collectés. L’analyse de la diversité des espèces a révélé cinq espèces de Culicidae dans toutes les préfectures (Conakry, Kindia, Kankan, Mamou, Labé et N’Zerekore). Les abondances relatives des différentes espèces variaient selon la préfecture. La plus grande proportion d’Aedes aegypti a été trouvée à N’Zerekore (16,27 %), tandis que la plus faible proportion a été trouvée à Mamou (3,17 %). De même, N’Zerekore a enregistré la plus forte proportion d’espèces forestières Aedes vittatus (33,49 %). De plus, Kankan se caractérise par une abondance d’Anopheles pharoensis, tandis que Conakry se caractérise par une abondance de Culex quinquefasciatus (44,22 %). De plus, Anopheles funestus était relativement plus abondante à Kindia (32,56 %). Dans l’ensemble, Culex quinquefasciatus était l’espèce la plus abondante, suivie d’Anopheles funestus, Anopheles pharoensis, Aedes vittatus et Aedes aegypti, avec des proportions de 32,36 % [30,92–33,84], 24,84 % [23,51–26,21], 18,12 % [16,95–19,35], 16,22 % [15,1–17,4] et 8,46 % [7,64–9,37], respectivement (Tableau 3).

Tableau 3 Diversité des moustiques dans certaines préfectures de la République de Guinée

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  1. nombre ni, proportion Pi, intervalle de confiance CI

Évaluation de la circulation des arbovirus dans la population de moustiques vecteurs

Les résultats ont révélé une infection à Culex quinquefasciatus à tous les endroits. Kankan et N’Zerekore présentaient les taux d’infection les plus élevés, respectivement à 75 % et 100 %. De plus, 33,3 % et 50 % des spécimens collectés d’Anopheles funestus ont également été identifiés comme étant infectés par le virus du Nil occidental. Aucun cas d’infection n’a été détecté chez Aedes aegypti, Aedes vittatus et Anopheles pharoensis (tableau 4).

Tableau 4 Répartition des taux d’infection par le WNV au sein des populations de vecteurs

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  1. N : nombre total de pools testés à chaque emplacement, n : nombre de pools où le virus du Nil occidental (WNV) a été détecté

 

Discussion

Cette étude met en lumière la circulation des arbovirus dans plusieurs préfectures de Guinée. Il intègre des données sérologiques et entomologiques humaines afin de caractériser la circulation du DENV, du YFV et du WNV. Compte tenu de l’émergence et de la réapparition de ces arbovirus, ces résultats sont essentiels pour orienter les stratégies de surveillance.

Les résultats sérologiques suggèrent une exposition antérieure à trois arbovirus (DENV, YFV et WNV) dans la population humaine. Des études antérieures [25] ont documenté la circulation des arbovirus, y compris la dengue et le virus du Nil occidental, en Guinée. De plus, des recherches plus récentes menées par [26] ont confirmé la circulation de la dengue et du virus du Nil occidental au sein de la population humaine de la République de Guinée. Ces résultats confirment la circulation de ces virus dans le contexte de l’Afrique de l’Ouest. En effet, des études de séroprévalence menées en Afrique de l’Ouest, notamment au Sénégal, au Burkina Faso, au Togo et au Nigeria, ont rapporté une circulation du virus de la dengue, et ces pays sont considérés comme endémiques [27,28,29]. Les résultats suggèrent une exposition régulière plutôt qu’une transmission épidémique sporadique.

De plus, des preuves sérologiques d’exposition aux trois virus ont été détectées dans les dix-huit préfectures étudiées, suggérant une large répartition géographique à travers la Guinée. Une séroprévalence plus élevée a été observée en Guinée supérieure et en Guinée forestière, qui sont réparties par zone écologique. La large répartition géographique de la séropositivité pourrait être en partie liée à la large répartition des vecteurs compétents, en particulier Aedes aegypti, à travers le pays. La capacité de ces vecteurs à s’adapter et à proliférer dans des environnements tropicaux humides pourrait contribuer au maintien de la transmission des arbovirus en Guinée [19, 30,31,32].

La séroprévalence la plus élevée des anticorps contre la dengue et la fièvre jaune a été observée chez les individus âgés de 25 à 64 ans. Ce schéma pourrait être lié à une plus grande exposition professionnelle et extérieure chez les adultes, étant donné que les vecteurs responsables de ces maladies sont principalement diurnes [33]. Ces résultats sont cohérents avec ceux de Sautereau et al. [34], qui ont démontré que la plupart des infections causées par ces virus surviennent chez les adultes. Une réactivité sérologique à plus d’un arbovirus a été observée chez certains participants. La séropositivité concomitante pour la dengue et le virus de la fièvre jaune, ainsi que pour la fièvre jaune et le virus du Nil occidental, pourrait être liée au fait que les deux virus partagent des vecteurs moustiques communs [35].

Une association significative entre la dengue et la séropositivité de la fièvre jaune a été observée. De plus, une séroprévalence plus élevée a également été observée chez les éleveurs, les agriculteurs et les ingénieurs civils que chez les professionnels de santé et les commerçants. Cette tendance s’explique par le fait que ces maladies sont transmises par les mêmes vecteurs et que les groupes socioprofessionnels les plus touchés sont ceux qui y sont les plus exposés. Les éleveurs, agriculteurs et ingénieurs civils travaillent souvent en extérieur, ce qui augmente leur exposition à ces vecteurs exophages et diurnes et augmente le risque de recevoir une morsure infectieuse [36]. D’autres études ont également montré que la profession peut être un facteur de risque pour l’infection par l’arbovirus [37, 38].

Les résultats concernant la diversité et l’abondance des espèces vectrices ont révélé que Culex quinquefasciatus était le plus abondant, suivi d’Anopheles funestus, Anopheles pharoensis, Aedes vittatus et Aedes aegypti. Cette diversité s’explique par la diversité écologique du pays, caractérisée par des zones boisées favorables aux espèces forestières, telles qu’Aedes vittatus, ainsi que par des environnements urbains densément peuplés favorables à Aedes aegypti. Cependant, Culex peut s’adapter à n’importe quel environnement, bien qu’il préfère les environnements pollués qui lui fournissent de la matière organique [39,40,41].

Cette étude a étudié la séroprévalence et la circulation de ces virus au sein de la population de vecteurs afin d’améliorer la compréhension de la source des infections. Les résultats ont démontré la circulation du VNV au sein de la population de vecteurs. La détection simultanée du VNV chez l’humain et dans la population vectorielle est la preuve d’une circulation virale active, probablement endémique, en Guinée, qui est restée inaperçue en raison d’un manque de surveillance. Ces résultats mettent en lumière des lacunes significatives dans la surveillance, car le WNV est rarement pris en compte dans les algorithmes de diagnostic de routine pour les maladies aiguës fiébriles dans de nombreux contextes africains [42, 43].

La détection exclusive du WNV chez Culex quinquefasciatus et Anopheles funestus souligne encore davantage le rôle central des espèces de Culex dans la transmission du WNV. Ce phénomène a été documenté dans certains pays africains, notamment au Sénégal, en Mauritanie et en Afrique du Sud [44, 45].

Le taux de détection particulièrement élevé du WNV chez N’Zérékoré est également écologiquement plausible [46, 47].

Cette région boisée présente des conditions environnementales favorables à la prolifération de vecteurs, notamment des précipitations abondantes, des zones humides permanentes et des populations d’oiseaux denses. Ces caractéristiques sont similaires à celles décrites dans les foyers de diffusion du WNV en Ouganda, en République démocratique du Congo et dans le sud du Nigeria [48, 49].

La présence du virus WNO dans les vecteurs Anopheles funestus, même en petites proportions, mérite une attention particulière. Des études sur cette découverte ont été rapportées [50,51,52], suggérant qu’une infection transitoire résulte d’une repas sanguine contaminée ou d’un rôle potentiel de vecteur secondaire.

Cette étude suggère une exposition généralisée à la dengue, à la fièvre jaune et aux virus du Nil occidental dans différentes régions de Guinée. Ces résultats représentent un problème important de santé publique, notamment dans un contexte caractérisé par une transformation écologique rapide et un développement urbain accéléré dans plusieurs villes portées par le programme Simandou 2040. Le travail actuel s’inscrit dans les priorités stratégiques du programme Simandou 2040, qui met l’accent sur la prévention et le contrôle des maladies, ainsi que sur le renforcement des systèmes d’alerte précoce pour la détection des épidémies. Dans ce cadre, les maladies arbovirales et les infections zoonotiques émergentes sont reconnues comme des domaines critiques nécessitant une attention soutenue. De plus, les changements environnementaux en cours liés aux activités minières, à l’expansion urbaine et aux modifications des écosystèmes qui en découlent soulignent la nécessité urgente de mettre en place des systèmes de surveillance robustes pour atténuer le risque d’épidémies. À cet égard, l’étude actuelle soutient les objectifs du programme Simandou 2040 en contribuant aux efforts de surveillance des arbovirus, dans le but d’informer les autorités de santé publique des risques sanitaires potentiels et d’orienter la mise en œuvre de stratégies de prévention spécifiques à chaque région à travers le pays.

L’absence de DENV et YFV chez les moustiques, malgré leur présence dans la population humaine, pourrait refléter des dynamiques saisonnières. Une surveillance longitudinale continue serait nécessaire pour mieux caractériser la saisonnalité virale.

Dans l’ensemble, nos résultats soulignent la nécessité d’établir un système de surveillance intégré combinant la surveillance sérologique humaine, la surveillance entomologique et l’évaluation des risques environnementaux. Cela renforcerait notre capacité à détecter les menaces tôt, à guider les interventions ciblées de contrôle des vecteurs et à améliorer notre préparation face aux menaces arbovirales émergentes et réapparentes en Afrique de l’Ouest.

Cette étude présente plusieurs limites qui doivent être prises en compte. Premièrement, la confirmation sérologique des échantillons positifs à l’aide du test de neutralisation de réduction de la plaque (PRNT), considéré comme la méthode de référence pour différencier les infections arbovirales, n’a pas pu être réalisée. L’utilisation de ce test aurait réduit le risque de réactivité croisée inhérent aux méthodes sérologiques. De plus, le nombre relativement limité d’échantillons sérologiques disponibles dans certaines préfectures a réduit la puissance statistique des comparaisons géographiques et a pu affecter la représentativité des estimations de séroprévalence. De plus, la surveillance entomologique n’a pas été menée dans toutes les préfectures incluses dans l’enquête sérologique et n’a pas pris en compte les variations saisonnières, en particulier entre la saison sèche et la saison des pluies. Ces limitations ont pu conduire à une sous-estimation de la diversité et de la dynamique spatiotemporelle des populations vectorielles. Cette étude aurait pu permettre d’identifier les lignées virales du virus du Nil occidental circulant au sein des populations de vecteurs de moustiques, fournir des informations sur les événements d’introduction potentiels et faciliter la comparaison entre les souches détectées et celles circulant dans d’autres régions d’Afrique de l’Ouest.

Conclusion

Cette étude met en lumière l’exposition significative de la population de la République de Guinée au virus de la dengue (DENV), au virus de la fièvre jaune (YFV) et au virus du Nil occidental (WNV). La détection de l’ARN WNV chez les vecteurs moustiques, en particulier Culex quinquefasciatus, a confirmé la circulation virale active. Les agriculteurs adultes et les éleveurs semblent être les plus à risque de contracter la dengue et la fièvre jaune. Ces résultats soulignent la nécessité de renforcer la surveillance intégrée des arbovirus en Guinée en reliant la surveillance sérologique humaine aux investigations entomologiques afin d’améliorer la rapidité de la détection et de la réponse, soutenant ainsi efficacement les objectifs de santé publique du programme Simandou 2040.

Abréviations

DENV :

Virus de la dengue

YFV :

Virus de la fièvre jaune

WNV :

Virus du Nil occidental

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Remerciements

Nous remercions nos collègues et les autorités de l’IRBAG d’avoir facilité l’achèvement de ce travail.

Financement

Pas applicable.

Informations sur l’auteur

Auteurs et affiliations

  1. Institut de Recherche en Biologie Appliquée de Guinée (IRBAG), Kindia, Guinée

    Mamadou Boundoukhoura Bah, Mariama Diallo, Alphonse Keller Konkon, Mamadou Morou Barry, Aissatou Boiro, Ibrahima Baϊlo Diallo, Ibrahima Sory Sow, Thierno Amadou Labe Balde, Kirill Zakharov, Gbago Onivogui, Ekaterina Naidenova et Mohamed Sahar Traoré

  2. Centre de Recherche Virologique de Guinée, Conakry, Guinée

    Sanaba Boumbaly

  3. Centre de Recherche Et de Formation en Infectiologie de Guinée, Conakry, Guinée

    Salifou Talasson Bangoura

Contributions

Conceptualisation : M.B.B. et S.B. ; méthodologie : M.D., K.Z., I.B.D. et M.B.B. ; conservation des données : M.B.B., M.M.B. et I.S.S. ; analyse formelle : A.K.K., S.T.B., M.M.B., M.B.B. et I.S.S. ; visualisation : S.B., E.N. et M.S.T. ; rédigeant le brouillon original : M.D., T.A.L.B., A.B. et M.B.B. ; Écriture critique et édition : A.K.K., M.M.B., T.A.L.B., A.B., G.O., M.B.B. et M.S.T. Tous les auteurs ont examiné le manuscrit.

Auteur correspondant

Correspondance avec Mohamed Sahar Traoré.

Déclarations d’éthique

Approbation éthique et consentement à la participation

L’étude a été menée conformément à la Déclaration d’Helsinki. Le protocole a été examiné et approuvé par le Comité d’éthique institutionnelle de l’Institut de recherche en biologie appliquée de Guinée (autorisation n° 002/IRBAG/ED/ED/DG/2024). Il a également été soumis et approuvé par le Comité national d’éthique pour la recherche en santé de la République de Guinée (autorisation n° 129/CNERS/2024). Tous les participants ont fourni un consentement éclairé écrit avant l’inscription. Pour les participants illettrés, la procédure de consentement suivait les directives éthiques nationales. Toutes les données ont été anonymisées et l’accès restreint au personnel autorisé de l’étude.

Consentement à la publication

Pas applicable.

Intérêts concurrents

Les auteurs ne déclarent aucun intérêt concurrent.

Informations complémentaires

Note de l’éditeur

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Rights and permissions

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Bah, M.B., Diallo, M., Konkon, A.K. et al. Étude de la circulation de la dengue, de la fièvre jaune et des virus du Nil occidental en Guinée : implications pour atteindre les objectifs sanitaires du programme Simandou 2040. Trop Med Health 54, 133 (2026). https://doi.org/10.1186/s41182-026-01031-4

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