Le Département de Microbiologie - Parasitologie regroupe en son sein quatre (4) laboratoires qui sont animés par des Chef de laboratoire nommés par décision du Ministère en charge de recherche scientifique, sur proposition du Directeur Générale
Le Département de Microbiologie-Parasitologie est chargé de :
- Surveiller les maladies bactériennes et virales à potentiel épidémique ;
- Conduire des programmes de recherche-dévéloppement dans le domaine de la microbiologie et de la parasitologie ;
- Contribuer à la surveillance de la résistance aux antimicrobiens ;
- Mener des études sur les virus et parasites notamment leur épidémiologie, leur écologie et les agent vecteurs ;
- Dévélopper des outils de diagnostic basés sur la génomique.